多由血热肠燥，大便秘结，排便过于用力，使肛门皮肤破裂，反复而发病。《医宗金鉴·外科心法要诀》中说："肛门围绕，折纹破裂，便结者，火燥也。"扼要阐述了因热结肠燥，或因阴虚津亏而致大便秘结，排便用力，使肛门皮肤裂伤，随后又继发感染，逐渐形成慢性、梭形溃疡。但也有因肛管狭窄、肛门湿疹、痔疮损伤等感染而发病。具体地讲，本病的发生主要与下列因素有关：
1.解剖学因素：肛门外括约肌浅部，从尾骨起，向前至肛门后方。分为两束，沿肛管两侧向前围绕，至肛门前方，又相互联合。因此，在肛门前后都留有间隙。并且肛提肌的大部分均附着于肛管两侧，前后较少。可见，肛门前、后方不如两侧牢固，容易受损伤。并且向下、向后与直肠形成一近90度的角。因此，肛门后部受粪便压迫较重，又因肛管后部血液循环不足，弹性较差，肛门腺分布又较多，这些都是发生肛裂的因素。
2.外伤学说：干硬的粪便或异物容易引起肛管皮肤的损伤，这是引起肛裂的主要因素。
3.感染学说：主要是肛门后部的肛隐窝感染，炎症向肛管皮下部蔓延，致使皮下脓肿破溃而成肛裂。
4.内括约肌痉挛学说：由于肛管部位损伤或炎症刺激，使肛门括约肌处于痉挛状态，致使肛管张力增强，易损伤成肛裂。
5.肛门狭小学说：肛管皮肤在发育中迟缓，生成肛管狭小，易损伤成肛裂。
中医认为肛裂的发生原因
中医认为肛裂的发生多由燥火、湿热蕴结肛门以及血虚肠燥所致。
①感受风火燥热邪气：燥火结于胃肠，灼伤津液，粪便坚硬干结，难以排出，强努而损伤肛门，造成裂口，裂口因便秘而反复加深，久不愈合，导致肛裂。
②湿热蕴结于肛门：外感湿热邪气，内积醇酒肥甘，以致湿热蕴结胃肠，下注肛门生痈，痈溃不愈而成肛裂。
③血虚肠燥：老人、产后及贫血病人，血虚肠燥而为便秘，最易发生肛裂。
