子宫内膜异位症的疼痛一般多位于下腹部、腰骶部或者是盆腔的中部，有一些患者也会放射到会阴部、肛门和大腿。大部分是月经来潮的出时候出现疼痛，而且整个经期都一直持续腹痛，疼痛的严重程度和子宫内膜异位症病灶的大小不一定成正比。如果是粘连特别严重的卵巢异位囊肿患者，有可能并没有疼痛，而盆腔内散在的病灶引起的疼痛却是难以忍受的，而且有少数患者可以表现为持续性的下腹疼痛，在月经期加重，但是也有一些患者，没有明显的腹痛的情况，所以不能单纯地根据痛经来判断是否有子宫内膜异位症。
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