婴儿乳糖不耐受多久自愈需要根据实际情况进行判断，具体如下：
乳糖不耐受一般是指患者无法完全消化乳制品中的乳糖。如果属于先天性乳糖酶缺乏，由于病情非常罕见，而且病情严重，受理婴儿自出生起就会出现腹泻，腹胀和营养不良，一般不会自愈。
如果患者属于继发性乳糖酶缺乏，通常是由于肠道各种感染性疾病、克罗恩病或者是放射性肠炎等，导致肠绒毛受损伤而出现乳糖酶的缺乏，出现腹泻，当绒毛病变修复，分泌足量乳糖酶后，需要数周或者是数月能够自愈。
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