一般情况下，孕晚期可以在医生指导下喝连花清瘟颗粒。孕妇在妊娠之后，体内的一些酶和激素都发生了一定程度的变化，在使用某些药物时，可能会对药物的代谢过程造成了一些不同于怀孕期前的影响，所以怀孕后服用药物时，需要更加谨慎。但是连花清瘟颗粒不属于孕期的禁用药物，而且连花清瘟颗粒属于中成药，本身的毒性就较低，所以孕晚期是可以在医生指导下喝连花清瘟颗粒。
怀孕期间使用药物时要更加谨慎，不可以盲目地使用，怀孕后的体质与怀孕前是不同的，不能根据之前的经验自行使用药物，如果身体发生疾病，需要及时去医院就诊，听从医生的建议和指导。同时有怀孕期间生病的情况，则更加需要注意饮食和休息，需要多吃一些富有维生素，清淡、不具刺激性的食物，保证睡眠充足，促进身体新陈代谢，增加自身免疫力。