一般情况下，吃完莫沙必利胃不舒服可能是莫沙必利过快促进肠道蠕动造成的。莫沙必利能够促进胃肠道运动，对于消化不良病人的胃肠道症状有改善作用。因而常用于缓解慢性胃炎伴有的消化系统症状，如胃灼热、早饱、上腹胀、上腹痛、恶心、呕吐等。所以吃完莫沙必利胃不舒服，可能是莫沙必利的药效在发挥。此时可以通过停止使用药物，适量饮用温水等方式进行改善。
同时需要注意的时莫沙必利不适合所有人服用。服用莫沙必利后也可能出现一定的腹泻、腹痛、口干、皮疹及倦怠、头晕等症状。对莫沙必利过敏的人群是禁止服用的，同时对于儿童、妊娠和哺乳期妇女以及老人在服用药物的时候需要慎重服用。