通常情况下，新生儿眼睛有眼屎可能是由于患有结膜炎、泪囊炎等疾病导致的，建议患者及时前往医院，在医生的指导下通过应用药物、改善生活习惯、按摩等方式进行治疗。
1.结膜炎
结膜炎的病因与受到感染、理化刺激等因素有关，通常会伴随眼部异物感、烧灼感等症状，眼屎多也是结膜炎的典型症状之一。建议患者可以遵循医嘱应用夫西地酸滴眼液、阿昔洛韦滴眼液等药物进行治疗。注意对新生儿眼部做好保护措施，避免受到强光的刺激，同时妇女在此期间应当注意避免食用生冷、辛辣、刺激性等的食物，可以适当多吃一些富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，从而在一定程度上帮助身体恢复。
2.泪囊炎
当新生儿受到细菌感染后，可能会出现泪囊炎的情况，表现出流泪、泪囊区肿胀等现象，也会出现新生儿眼睛有眼屎的情况。家长可以询问医生建议，在医生指导下应用妥布霉素滴眼液、盐酸左氧氟沙星滴眼液等药物进行治疗。此外建议可以对新生儿泪囊进行适当按摩，使分泌物向下冲破先天残膜，有助于病情的恢复。