做结肠镜后应以清淡易消化的食物为主，这是由于做结肠镜前需通过泻药或物理灌肠等方式清空肠道，做肠镜也会导致肠道黏膜受到刺激，因此做肠镜后，胃肠道较为敏感，因此应以流质少渣的食物为主。这类食物包含粥类，如小米粥、白粥等。为保证身体所需营养，还可食用鸡蛋羹、蛋花汤等，同时牛奶豆浆等可增加身体所需蛋白质，也是较好的食物，需注意做肠镜后应避免饮酒，吃生冷、辛辣刺激类食物，以免由于肠道敏感产生腹泻、腹痛等症状。
通常建议做肠镜后，禁食12小时以上，才可缓慢进食。在肠镜后3天~5天内，都应以清淡易消化，半流质、流质的食物为主。做肠镜后若有腹痛，腹泻等症状，且腹泻不止时应在医生指导下使用药物进行止泻，可用药物有蒙脱石散、乳酸杆菌等。以上药物仅供参考，具体应遵医嘱。