这里的第三针疫苗如果指的是新冠疫苗的话，那么打新冠疫苗第三针发现怀孕了一般情况下是不影响的，因为在备孕期间可以打疫苗的，所以像这种情况不用过度担心。但是具体情况还需要根据医生建议以及自身身体状况决定。
国家对于注射疫苗明确解释是怀孕的孕妇暂时不打疫苗，但是打疫苗过程中间发现怀孕的，也可以考虑继续妊娠，因为对于疫苗是孕妇或者准孕妇出于伦理的需要，这部分人群没有做实验，所以没有资料可以支撑。所以孕妇此时应该注意观察注射后是否有发热、发红、头晕、恶心呕吐等副作用，并且应该定期进行妊娠检查，尤其是妊娠中期的四维彩色多普勒超声检查，以及时了解胎儿的发育情况，如果在检查发现胎儿发育畸形，如严重的心脏畸形或大脑畸形，此时应该及时终止妊娠。所以在新冠疫苗接种后如果发现怀孕了，孕妇需要定期到医院进行密切监测，并且应该注意保持舒适的心情，避免过度焦虑。