三个多月宝宝老是摇头可能是由于睡眠环境不佳、缺钙等原因引起的。建议家长及时带宝宝就医，并在医生的指导下通过改善日常生活习惯、应用药物等方式进行治疗。三个多月宝宝老是摇头还可见于其他原因，建议前往专业医院，明确病因后在医生的指导下进行相应处理。
1.睡眠环境不佳：如果宝宝的睡眠环境不好，比较炎热或嘈杂，不利于宝宝睡眠，宝宝会出现睡眠不安稳的症状，就有可能会出现老是摇头的现象。建议患儿家长为宝宝提供安静的睡眠环境，保持室内湿度适宜，可以提高宝宝的睡眠质量进行改善。
2.缺钙：由于三个月宝宝的体内缺少钙元素，就可能会导致宝宝的神经过度兴奋，通常会出现哭闹、难以入睡和老是摇头等不良反应。建议家长为宝宝补充充足的钙元素，还可以多晒太阳，促进体内维生素D的合成，有利于钙质的吸收。家长还可以在医生的指导下，给三个月的宝宝应用葡萄糖酸钙口服液、碳酸钙D3颗粒等药物进行治疗。