奥美拉唑和胃舒平都可用于治疗消化系统疾病，主要是在药物成分、作用机制以及药效和所治疗的疾病等方面存在区别，奥美拉唑主要通过抑制胃酸分泌达到药效，胃舒平主要是通过中和多余胃酸以及止痛的作用来达到药效。
1.奥美拉唑多为片剂、胶囊剂、注射剂，是质子泵（H+，K+-ATP酶）抑制剂，可用于消化道溃疡如胃溃疡、十二指肠溃疡还有应激性溃疡等，以及反流性食管炎、胃泌素瘤（卓－艾综合征）等疾病。
2.胃舒平又称为复方氢氧化铝片，是由氢氧化铝、三硅酸镁、颠茄流浸膏组成的复方制剂，可用于缓解胃酸过多引起的胃痛或胃灼热感（烧心），以及反酸，也可用于慢性胃炎。