吃了幽门螺旋杆菌的药大便不臭了，通常是因为药物达到了治疗效果，并且在用药期间患者养成了良好的饮食习惯等原因导致的。
1、良好的治疗效果
幽门螺旋杆菌容易引起胃肠道消化不良，表现出恶心、食欲不振、大便臭、口腔异味等症状。在医生指导下应用阿莫西林、奥美拉唑等治疗幽门螺旋杆菌的药物能够改善肠道的菌群环境，有助于胃肠道消化和吸收，起到良好的治疗效果，因此排出的大便就不臭了。
2、良好的饮食习惯
通常饮食结构对人体排出的大便气味能够产生重要的影响。患者大便不臭了可能是因为在吃药期间养成了良好的饮食习惯，比如注意荤素搭配、多吃蔬菜和水果、食用清淡且含有高纤维素的食物等，有助于肠道内正常菌群的生长，当人体的胃肠道里面含有良好的细菌菌群时，食用的食物也就能够得到消化，因此吃了幽门螺旋杆菌的药大便不臭了。