近亲结婚的健康风险主要包括隐性遗传病风险增加、先天畸形概率升高、多基因疾病易感性增强、免疫系统缺陷以及智力发育异常等。这些风险与遗传基因的高度相似性密切相关，可能对后代健康造成严重影响。
1、隐性遗传病风险增加
近亲携带相同隐性致病基因的概率显著高于普通人群。当父母双方都携带同一致病基因时，后代有25%概率患病，如白化病、苯丙酮尿症等单基因隐性遗传病的发生率可达普通人群的数十倍。这类疾病通常会导致代谢异常或器官功能障碍。
2、先天畸形概率升高
血缘关系越近，胚胎发育异常风险越高。研究显示三级血亲结婚的子代先天畸形率比普通人群高8-10倍，常见类型包括先天性心脏病（如室间隔缺损）、神经管畸形（如脊柱裂）以及唇腭裂等形态发育异常。
3、多基因疾病易感性增强
高血压、精神分裂症、糖尿病等复杂疾病受多个基因共同影响。近亲婚配可能累积多个微效有害等位基因，使这些疾病的发病风险提高2-3倍，且发病年龄可能提前。
4、免疫系统缺陷
人类白细胞抗原（HLA）系统的多样性对免疫功能至关重要。近亲后代HLA基因相似度较高，导致免疫识别能力下降，对病原体抵抗力减弱，自身免疫性疾病发生率也会上升，如类风湿性关节炎的患病风险增加约1.5倍。
5、智力发育异常
近亲生育可能影响神经发育相关基因的表达。统计数据显示，近亲婚配后代出现智力低下（IQ小于70）的比例约为4-8%，较普通人群高3-5倍，且学习障碍、自闭症谱系障碍的发生率也显著上升。
建议有血缘关系的婚配者在婚前进行详细的遗传咨询，孕期应加强产前诊断，包括绒毛取样、羊水穿刺等检测。新生儿出生后需进行代谢病筛查和发育评估，发现异常及时干预。从优生优育角度考虑，应尽量避免三代以内的近亲通婚。