灰指甲的治疗方法需根据患者的具体情况选择，通常包括外用药物、口服药物、联合治疗、激光治疗及手术拔甲等。临床不存在适用于所有人群的最佳药物，需在医生指导下规范治疗。
1、外用药物
适用于病情较轻或不宜口服药物者。常用药物如特比萘芬乳膏、阿莫罗芬搽剂、环吡酮胺软膏等，可直接抑制皮肤癣菌。需每日清洁患处后涂抹，并坚持使用3-6个月。使用期间若出现局部红肿需停用。
2、口服药物
适用于甲板受累面积超过50%或合并其他部位感染。常用伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片、氟康唑胶囊等，通过抑制真菌细胞膜合成发挥作用。肝功能异常者需慎用，服药期间需定期监测转氨酶水平。
3、联合治疗
外用药与口服药联用可提高治愈率，适用于甲板增厚超过2毫米或药物治疗效果不佳者。通常先采用口服药物系统治疗，再配合外用药物巩固疗效，总疗程需持续6-12个月。
4、激光治疗
利用光热效应杀灭甲床真菌，适用于药物治疗不耐受者。每次治疗间隔4周，需进行3-5次治疗，可能出现暂时性疼痛感，治疗后需保持患甲干燥。
5、手术拔甲
适用于单个病甲严重增厚或合并嵌甲感染者。通过手术去除病甲后暴露甲床，术后需每日消毒换药，待新生甲板完全长出约需6个月，存在继发感染风险。
日常需保持足部干燥清洁，避免共用鞋袜及修甲工具。建议每3个月复查真菌镜检，治疗期间避免美甲或使用刺激性化学物品。出现甲板分离、甲下出血等异常情况应及时复诊调整治疗方案。