口腔溃疡通常可以挂口腔科、口腔黏膜科或皮肤科就诊，具体需根据医院科室设置及患者症状选择。若医院未细分科室，可先到普通口腔科或内科进行初步检查。
1、口腔科
口腔科是处理口腔溃疡的首选科室，医生会通过视诊、触诊等方式评估溃疡的大小、形态及位置，排查是否有局部刺激因素如牙齿残根、不良修复体等，并给予相应的局部药物治疗或建议。对于复发性或顽固性溃疡，口腔科医生可能开具漱口水、含片或凝胶类药物缓解症状。
2、口腔黏膜科
部分三甲医院设有口腔黏膜专科，专门诊治口腔黏膜类疾病。该科室医生对白塞病、扁平苔藓等原因引起的溃疡有更丰富的诊疗经验，可通过病理活检、血液检查等手段明确病因，制定系统性治疗方案，如免疫调节治疗或中西医结合疗法。
3、皮肤科
若口腔溃疡合并外阴溃疡、皮疹、关节疼痛等症状，可能与白塞病、红斑狼疮等全身性疾病相关，此时需到皮肤科就诊。皮肤科医生会根据皮肤表现、免疫学指标等综合判断，必要时联合其他科室进行多学科诊疗。
日常应注意避免进食辛辣、过烫食物，保持口腔清洁。若溃疡持续2周未愈、反复发作或伴有发热、体重下降等症状，建议及时就诊。用药需严格遵循医嘱，不可自行长期使用含激素类口腔制剂。