巧克力囊肿存在一定的复发概率，其是否复发与治疗方式、术后管理等因素有关。部分患者在手术后可能出现复发，需通过定期复查和健康管理降低风险。
巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种表现，其复发风险与治疗是否彻底密切相关。例如，若通过腹腔镜手术仅剥离囊肿而未能彻底清除异位内膜病灶，残留的内膜组织可能继续增殖，导致囊肿复发。此外，囊肿体积较大或存在盆腔广泛粘连的患者，术后复发率相对较高。临床数据显示，术后未进行药物巩固治疗的患者，五年内复发率可达30%-40%。
术后管理措施是否到位也会影响复发概率。部分患者术后需要遵医嘱使用促性腺激素释放激素激动剂如亮丙瑞林、戈舍瑞林等药物，抑制卵巢功能以减少雌激素分泌，从而降低异位内膜活性。若患者未能规范用药或擅自停药，可能削弱治疗效果。
即使通过手术完全切除病灶，患者自身激素水平波动仍可能诱发新的囊肿形成。例如，卵巢功能活跃、月经周期规律的患者，盆腔环境更有利于内膜细胞种植生长。此外，遗传因素或免疫异常导致的内膜细胞异常黏附能力，也可能增加复发风险。
建议术后每3-6个月进行妇科超声检查，监测卵巢情况。日常生活中应注意保持规律作息，避免过度劳累。若出现进行性加重的痛经、性交痛等症状，应及时就医复查。育龄期女性可根据生育需求，在医生指导下选择合适的治疗方案。