卵巢囊肿是否会引起肚子疼不能一概而论，需根据囊肿的性质、大小及是否出现并发症进行判断。部分患者可能无明显症状，而部分患者可能因囊肿破裂、扭转或感染引发疼痛。
1、生理性囊肿
多数情况下，卵巢生理性囊肿体积较小且可自行消退，通常不会引起明显的腹部疼痛。此类囊肿多为滤泡囊肿或黄体囊肿，与月经周期相关，可能在体检时偶然发现，患者一般无不适感。
2、病理性囊肿
当囊肿直径超过5厘米或持续存在3个月以上时，可能出现下腹坠胀感。子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）因囊内出血刺激腹膜，常伴随进行性加重的痛经和性交痛。卵巢浆液性或黏液性囊腺瘤随着体积增大，可能压迫邻近器官产生隐痛。
3、并发症情况
囊肿蒂扭转是妇科急腹症，突发剧烈腹痛伴恶心呕吐，因囊肿带部扭转导致血供中断。囊肿破裂时囊液刺激腹膜会引起急性腹痛，出血较多者可出现休克症状。合并感染时除持续下腹痛外，还可能伴随发热、异常阴道分泌物等。
建议女性定期进行妇科超声检查，尤其出现持续性腹痛、月经紊乱或腹部膨隆等症状时，应及时就诊。医生会根据超声、肿瘤标志物等检查结果评估囊肿性质，必要时通过腹腔镜探查明确诊断。对于无症状的小囊肿可定期观察，而存在并发症或可疑恶变者需手术治疗。