肺炎克雷伯菌感染的严重程度因患者自身免疫状态、感染部位及细菌耐药性等因素而异。免疫力低下、合并基础疾病或感染耐药菌株时，可能导致病情加重甚至危及生命。
1、患者免疫状态
免疫力正常者感染后通常表现为轻度呼吸道或泌尿道感染，经规范抗感染治疗后预后较好。但免疫功能低下者如糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的患者，感染后易发展为重症肺炎、脓毒症或多器官功能衰竭，死亡率可达20%~30%。
2、感染部位
肺部感染常见高热、咳嗽脓痰，可能形成肺脓肿或脓胸。血行播散可引发感染性休克，肝脓肿型感染可能伴随眼内炎、脑膜炎等迁徙性病灶。中枢神经系统感染死亡率高达50%，需及时进行脑脊液引流和强力抗菌治疗。
3、细菌耐药性
产超广谱β-内酰胺酶菌株对三代头孢菌素耐药，碳青霉烯类耐药菌株治疗选择更有限。多重耐药菌感染患者住院时间延长3倍，死亡率较敏感菌株增加2-3倍。高毒力菌株（如ST23型）具有较强的侵袭性和传播能力，可在社区健康人群中引发严重感染。
该菌感染需在确诊后尽早进行药敏试验指导用药，临床常用治疗方案包括头孢曲松、哌拉西林他唑巴坦或碳青霉烯类药物。重症感染建议联合阿米卡星或多黏菌素，治疗周期需持续至体温正常后7-10天。日常应注意手卫生、避免滥用抗生素，糖尿病患者需严格血糖控制以降低感染风险。