怀孕期间进行DNA亲子鉴定通常有无创胎儿亲子鉴定、绒毛膜穿刺、羊水穿刺等方式，需在专业医疗机构由医生操作。具体方法的选择需根据孕周、孕妇身体状况等因素综合评估。
1、无创胎儿亲子鉴定
该方法通过采集孕妇静脉血，分离其中的胎儿游离DNA进行检测，通常孕5周后即可进行。其优势在于无创性，对胎儿和孕妇风险极低，但检测成本较高。检测时需同时采集疑似父亲的血液、唾液等样本进行比对，准确率可达99%以上。
2、绒毛膜穿刺
适用于孕11-13周的孕妇，在超声引导下通过宫颈或腹壁获取胎盘绒毛组织。操作存在0.5%-1%的流产风险，且可能引起阴道出血或感染。检测需结合父母双方样本，3-5个工作日出结果，准确性与羊水穿刺相当，但操作难度较高。
3、羊水穿刺
多在孕16-24周进行，通过穿刺抽取羊水中的胎儿脱落细胞。该方法检测准确率接近100%，但存在约0.3%的流产风险，可能出现宫缩、羊水渗漏等并发症。需在具备产前诊断资质的医院进行，检测周期约7-10天。
建议孕妇选择国家认证的第三方司法鉴定机构或三甲医院进行检测，术前需完善超声、凝血功能等检查。鉴定前应充分了解不同检测方式的风险性，与产科医生沟通选择适宜方案。需注意此类检测涉及伦理问题，实施前应取得所有相关方的知情同意，并妥善处理检测结果可能引发的家庭关系问题。