芥菜根作为药食两用的植物，在中医理论中具有一定的药用价值。其功效作用主要包括止咳化痰、促进消化、消肿止痛、抗菌消炎以及补充营养等，但需注意其作为食材或中药材使用时需遵医嘱。
1、止咳化痰
芥菜根在中医理论中具有温肺化痰的作用，其辛散之性可帮助化解呼吸道痰液。对于寒痰咳嗽、痰白质稀的情况，适量使用可能辅助缓解症状，但需辨证使用。
2、促进消化
芥菜根含有膳食纤维和挥发性物质，能够刺激消化液分泌。其特有的辛辣成分可促进胃肠蠕动，对食欲不振、食积腹胀有一定改善作用，但胃溃疡患者应慎用。
3、消肿止痛
中医认为其辛温之性具有散结消肿的功效，外敷可用于缓解关节肿痛或轻微外伤。现代研究显示其含有的硫代葡萄糖苷衍生物可能具有抗炎作用，但需专业处理后方可使用。
4、抗菌消炎
芥菜根中的异硫氰酸酯类物质对部分细菌有抑制作用。实验研究表明其提取物对金黄色葡萄球菌等常见致病菌有抑制效果，但临床治疗仍需规范抗生素治疗。
5、补充营养
含有维生素C、钾、钙等营养素，其中维生素C含量可达30mg/100g左右，钾元素有助于维持电解质平衡，膳食纤维含量约2.1g/100g，可作为营养补充的辅助食材。
需要特别注意的是，芥菜根作为中药材使用时应严格遵循中医辨证原则，避免自行用药。其含有的芥子油苷等成分可能刺激黏膜，消化道疾病患者应慎用。建议在中医师指导下合理使用，日常食用也需注意适量。