过硼酸钠较具硷性，在肠道中与酸作用，可分解为硼酸盐（如NaBO2）、硼酸与过氧化物（如过氧化氢）。至于硼酸盐对人体的毒性并不高，但在大量暴露时，可对人体延髓areapostrema造成刺激，而引起自发性呕吐。另外，硼酸盐在单次大量或重覆暴露时，可对中枢神经系统与肾潘产生毒性，并可能引起维他命B2（riboflavin）缺乏。
硼酸盐中毒，通常为皮肤、伤口或口服，多次或长期暴露后才会引起症状。一般硼酸盐中毒可能致死之最低剂量，婴儿为2-3g，儿童为5-6g，成人为15-20g。临床表现方面，在肠胃道可能有黏膜变红、呕吐、腹泻、呕吐物及粪便呈蓝绿色或肠胃道出血等症状，并可因脱水导致低血压、心律不整、发绀及休克；肾潘方面则可产生寡尿或无尿、近端肾小管坏死、肾潘衰竭、代谢性酸血症等。至于中枢神经系统可导致头痛、步态不稳、感觉异常、躁动不安、虚弱、体温异常、手抖、抽搐、甚至于死亡。皮肤可产生手掌、脚掌及臀部产生脱皮及红疹现象，就有如熟的龙虾一般（boiledlobstersyndrome）；并可在口腔及肛门周围，或其他黏膜也引起类似的脱皮症状，及全身性的红疹。此种皮肤的症状为全身性症状，因此并非仅有皮肤暴露才会产生。如维他命B2缺乏，则可导致喉痛、咽部红肿、口角炎、舌炎、脂漏性皮肤炎或贫血等病症。
硼酸中毒的症状：开始为头痛，头晕，恶心，呕吐，腹部绞痛，腹泻，呕吐物及粪便常带血液，或呈蓝绿色；随即出现大片红色皮疹，1～2日后脱皮，偶发生剥脱性皮炎，粘膜也可有充血和剥脱现象；皮疹可以波及咽部及鼓膜，部分病人出现肝脂肪变性，黄疸以及肾脏损害，重症病儿常有感觉异常，视力障碍，共济失调，震颤，精神错乱，惊厥，谵妄，角弓反张，青紫和昏迷，体温，血压下降，病儿可于24小时至数日内因休克，尿毒症等而死亡，有些中毒婴儿在昏迷之前，仅有发热或体温下降的征象。
因硼酸盐会使维他命B2缺乏，且维他命B2可与硼酸盐形成水溶性复合物，减少其细胞毒性，并协助排除，因此在治疗方面，应静脉或肌肉注射补充维他命B21mg/Kg至于皮肤、眼睛或吸入暴露的处理，因硼酸盐刺激性很低，通常仅以水冲洗乾净或将患者移至空气新鲜处即可但对于皮肤多次或大量暴露者，仍应小心产生全身性中毒的可能
对于硼酸或硼酸盐中毒的病患，应监测电解质，肾臟功能，动脉血液气体分析及心电图等，另外可以测定血中硼酸盐的浓度，有助于临床上的诊断。
硼酸中毒除了常规的治疗外，饮食需注意：宜营养丰富、容易消化、清淡的食物，多吃水果、蔬菜，多饮水。忌辛辣食物。忌油腻厚味。
口服硼酸中毒时，立即催吐并选用2％～5％碳酸氢钠溶液(硼砂中毒勿用)、生理盐水或微温清水等洗胃。洗胃后灌入硫酸钠导泻，其他部位沾染的硼酸亦需用生理盐水、清水或肥皂水等洗净。静脉滴注葡萄糖盐水和血浆对治疗休克及加速毒物排泄均有助益。亦可静滴生理盐水。如有酸中毒，应用适量乳酸钠或碳酸氢钠溶液，纠正脱水、酸中毒后，持续静脉滴注5％～10％葡萄糖和含钠溶液，维持尿呈碱性，以利硼酸排出。严重病人可考虑换血、血液透析或腹膜透析等疗法。其他为对症治疗。
硼砂中毒的治疗和硼酸类似，但洗胃不用碱性溶液。对惊厥除应用镇静剂外，并可酌用10％葡萄糖酸钙10～20ml，加入葡萄糖液20～40ml内缓慢静注。