棉籽油的危害可能会导致慢性疾病的发生几率增加，而且导致男性生殖功能下降的可能性增加。每个人的体质不同以及摄入量的多少不同，对身体产生的影响程度会有所偏差。
1、慢性疾病发生几率增加：棉籽油当中会含有油脂成分，同时也含有脂肪和胆固醇成分，如果不无控制摄入量在过量吃了以后，可能会导致体内的油脂和胆固醇摄入过多，容易引起高脂血症或者高胆固醇血症，引起心脑血管疾病的发生几率增加，严重的会引起生命危险。
2、男性生殖功能下降：盐籽油当中会含有棉酚成分，如果不控制摄入量，在过量摄入以后会损害男性的生殖系统，可能会引起睾丸萎缩，并且也会导致生精细胞损害，会导致精子生成量减少，容易引起受孕困难或者不孕不育症。
棉籽油如果根据自身的健康情况控制摄入量，如果只是适当的吃，能够达到补充营养物质的作用。比如可以达到补充维生素和矿物质的作用，同时也能够达到补充微量元素的作用，对身体有一定的好处，并不会引起严重的损伤。
